Получили широкое распространение элементы мусульманской культуры — литература, искусство, философия. Распространяются сюжеты и герои мусульманского мира: это «Сказание об Александре Македонском» («Хикайят Искандар Зулкарнаин»), «Сказки из Калилы и Дим-ны», персидские сказания об Амире Хамзахе и др.

В результате вторжения иностранцев и бесконечных междоусобных войн, а также вследствие борьбы между исламом и доисламскими традициями культура Индонезии переживала глубокий и затяжной кризис.

В 1749 г. сусухунан Пакубувана II (букв, «стержень мира») на смертном одре завещал свое государство Ост-Индской компании, которая отныне на правах сюзерена могла передавать его в лен наследникам Пакубуваны.

Всеобщее недовольство гнетом компании и феодальной эксплуатацией вылилось в новое восстание, которое возглавил Сурапати — в прошлом балийский раб, проданный компании, бежавший из Джакарты и снова поступивший на службу к компании во главе военного отряда.

Компания осуществляла варварскую эксплуатацию страны с помощью самых разнообразных методов. Первое место среди них занимала строжайшая монополия на торговлю пряностями, а также опиумом, солью и всеми теми продуктами, продажа которых становилась выгодной.

В 1677 г. Амангкурат I умер. По договору, заключенному в том же году, компания обещала помочь его сыну, вступившему на престол.

Драматические события развернулись на Яве, где в 1674 г. поднялось широкое движение, направленное против жестокого феодального гнета и голландского проникновения.

Население Индонезии быстро убедилось, что алчность голландских захватчиков не уступает корыстолюбию португальских.

Для развития успехов компания стремилась приобрести территориальную базу. Играя на противоречиях между правителями Бантама и соседнего княжества Якатра (бывшая Сундакелапа), генерал-губернатор Нидерландской Ост-Индии (так называли Индонезию голландские захватчики) Ян Питерсзоон Кун добился от султана Якатры ряда привилегий.

Естественный ход исторического и социально-экономического развития Индонезии, нарушенный португальцами, был еще более грубо прерван торговцами из Нидерландов.

Матарам в начале XVI в.— небольшой удел, располагавшийся на том месте, где с VII в. (а возможно и раньше) и до начала XIII в.

Во второй половине XVI в., после более чем полустолетнего периода раздробленности и упадка, последовавшего за крушением Маджапахита, в Индонезии образовалось несколько новых экономических центров и наметилась тенденция к образованию новых централизованных государств на обломках бывшей империи.

Сокровища Индии, Китая, Индонезии манили европейских купцов, но путь в эти страны был далек и труден.

На рубеже XV—XVI вв. возросла роль торгового пути вдоль берегов Западной Суматры. В это время и возвысился на севере Суматры султанат Аче, ставший соперником Малакки в торговле.

Падение государства Маджапахит усилило раздробленность Индонезии. К началу XVI в. в стране существовало несколько государств, структура которых была уже в значительной мере феодальной или процесс феодализации завершился в них на протяжении периода позднего средневековья.